Le collège Notre-Dame du Bon Accueil propose un cursus « classique », de la 6e à la 3e et trois classes à projets spécifiques :
• classes sensibilisées aux difficultés d’apprentissage destinée à des élèves à besoins éducatifs particuliers,
• une 4ème aménagée avec plusieurs semaines de stage, qui permettent aux élèves d’envisager leur orientation,
• une 3ème aménagée pour préparer à un projet professionnel dès la sortie du collège (apprentissage ou autre...)

Chaque soir une étude surveillée et dirigée est proposée à tous les élèves :
- pour les 6ème et les 5ème, étude avec un éducateur scolaire et un enseignant au minimum une fois par semaine,
- pour les 4ème et 3ème, étude dirigée avec un accompagnement par un éducateur scolaire qui a pour objectif la mise en autonomie du jeune. Au terme de l’étude, les éducateurs scolaires rendent compte aux professeurs principaux du travail effectué par chaque jeune.

Pour que les jeunes reprennent confiance en eux, de nombreux projets sont menés au sein de l’établissement. Des séjours ou sorties pédagogiques sont régulièrement organisés, ainsi que des classes découvertes culturelles, historiques.